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　　甲公司请求保护的软件的版本是“某管理系统3.1.46”，其提交的“某管理系统3.1.46”的源代码中多处存在甲公司署名信息。由于对软件公司来说，软件存在不同版本，不断更新迭代是常见现象，现有证据证明甲公司是“某管理系统V1.6.1”及“禾匠榜店商城系统V4.0.0”的权利人，结合某管理系统3.1.46的源代码中甲公司的相关署名信息，以上证据可以相互印证。在乙公司未提供相反证据的情况下，可以认定甲公司系涉案某管理系统3.1.46版本的著作权人，有权提起本案诉讼。

　　【法院认为】关于乙公司主张权利软件系开源软件，公众可免费使用问题。无论权利软件是否属于开源软件，甲公司对于其独立创作并具有独创性的软件整体或者部分享有著作权，软件开源并不等于放弃著作权；甲公司是否遵循开源协议与乙公司是否侵权属于不同的法律关系，不影响本案侵权行为的认定。关于乙公司主张其下载并使用被诉侵权软件仅用于学习和研究，并未商业使用问题。乙公司作为商业主体，其经营范围包括计算机软件开发、信息技术服务等，且乙公司使用被诉侵权软件为他人开发了小程序商城。据此，可以认定，乙公司作为商事主体在其经营范围内使用了权利软件的行为并非仅为学习和研究，而属于商业性使用。综上，乙公司的抗辩理由均不能成立。